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El Doctorado en Geografía y Ordenación Territorial es coordinado por el Centro de Estudios Estratégicos para el Desarrollo (CEED), perteneciente al Centro Universitario de Ciencias Sociales y Humanidades (CUCSH), al Centro Universitario de la Costa (CUC) y al Centro Universitario de los Valles (CUValles), de la Universidad de Guadalajara. Desde noviembre de 2013, forma parte del Padrón Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC) del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT).

El posgrado está dirigido a maestros egresados de campos del conocimiento de las Ciencias Sociales y las Humanidades, las Ciencias Ambientales, las Ciencias de la Tierra, las Ciencias Económico Administrativas y otras afines. Por lo que los candidatos deben estar interesados en el estudio de fenómenos territoriales y su ordenamiento. Recientemente este posgrado está inscrito en los Programas Nacionales Estratégicos (PRONACES) del CONACYT en la modalidad: Temas prioritarios para el estudio de políticas e instrumentos de desarrollo urbano y ordenamiento territorial para el acceso justo al hábitat, con el objeto de construir una Nueva Agenda Urbana en el país. 

El programa académico del Doctorado en Geografía y Ordenación Territorial es un programa con enfoque a la investigación, modalidad escolarizada, tutorial y de dedicación de tiempo completo, la duración es de 4 años equivalente a 8 semestres, cubriendo 166 créditos totales para la obtención del grado.